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Desafíos y oportunidades para cuantificar modificaciones postraduccionales utilizando nuevos flujos de trabajo y enfoques proteómicos

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Desafíos y oportunidades para cuantificar modificaciones postraduccionales utilizando nuevos flujos de trabajo y enfoques proteómicos

Prof. Birgit Schilling, PhD
Profesor asociado, Director del Instituto Buck del Centro de Tecnología de Espectrometría de Masas

Hemos estado utilizando sistemas TripleTOF de escaneo rápido para analizar una variedad de modificaciones postraduccionales PTM utilizando adquisiciones independientes de datos DIA y, más recientemente, monitoreo de reacciones múltiples de alta resolución MRM-HR para identificar, caracterizar ycuantificar péptidos que contienen PTM en un formato de alto rendimiento. Si bien se ha obtenido una gran cantidad de información utilizando enfoques tradicionales de fragmentación de CID, muchas de las modificaciones que estudiamos son altamente lábiles y difíciles de caracterizar.

Evaluamos un nuevo enfoque de fragmentación iónica para una mejor caracterización de PTM y una localización de sitios más detallada con el espectrómetro de masas SCIEX ZenoTOF 7600. Usando ejemplos de modificaciones clave encontradas en nuestros modelos de ratón sirtuin 5, demostraremos el impacto de este nuevo enfoque de fragmentación enevaluar el perfil de PTM durante la lesión renal y las posibles vías para protegerse de la lesión renal a través de niveles elevados de succinilación que podrían abrir vías terapéuticas.

Puntos clave de discusión :

  • Evaluación de un nuevo enfoque de fragmentación de iones por su impacto en la caracterización mejorada de PTM y una localización más detallada del sitio.
  • Demostración del impacto de este nuevo enfoque de fragmentación en la evaluación del perfil de PTM durante la lesión renal y las posibles vías para protegerse de la lesión renal a través de niveles elevados de succinilación que podrían abrir vías terapéuticas.
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